Prueba post-hoc para rANOVA y ANOVA mixto
29 Feb 2016 - Yutzil
La función TukeyHSD() sólo la podemos usar para las pruebas post-hoc de los ANOVAs de una vía.
Estos ANOVAs son de clases c('aov', 'lm') y la función TukeyHSD() sabe trabajar solo con esas clases.
Los rANOVA y ANOVA mixtos son objetos de las clase c('aovlist', 'listof').
Es por esto que no es posible utilizar la función TukeyHSD() para las pruebas post-hoc con esos ANOVAs.
Para las pruebas post-hoc para rANOVA y ANOVA mixto usamos el método pairwise.t.test().
Single Factor Repeated Measures ANOVA explica cómo utilizar la función pairwise.t.test con valores p ajustados.
Para ajustar los valores p, podemos aplicar los métodos de Bonferroni o Holm.
ANOVA Pairwise Comparison Methods explica estos dos tipos de ajustes.
Además, la ayuda de R (?p.adjust) nos proporciona más tipos de ajustes que podemos aplicar.
Sin embargo, en Error in TukeyHSD in R encontramos que es mejor utilizar un “linear mixed-effects model”.
Estas son otras referencias de interés:
- Repeated Measures ANOVA using R
- Esta página usa
pairwise.t.test()yTukeyHSD()para un ANOVA de una vía